Dựa trên cơ sở vi khuẩn H.pylori tiết ra nhiều men Urease đã phân hủy ure thành amoniac và làm cho môi trường trở nên kiềm tính, từ đó làm dung dịch ure – Indol màu vàng chuyển màu hồng tím.
Phương pháp xét nghiệm H.pylori này cho độ nhạy( 93- 97%), độ đặc hiệu( 95 – 100%).
Hạn chế của phương pháp này là độ nhạy thấp, cần phải có ít nhất 105vi khuẩn trong mảnh sinh thiết mới đủ để làm đổi màu dung dịch. Không thể dùng xét nghiệm này để chẩn đoán ở cuối đợt điều trị vì có thể vi khuẩn vẫn còn nhưng không nhiều không đủ để đổi màu dung dịch. Bên cạnh đó, có một số vi khuẩn tiết Urease có ở miệng như Streptococcus, Staphylococcus có thể cho kết quả dương tính giả.
